Podle Nařízení vlády č. 132/2005 Sb., kterým se stanoví Národní seznam evropsky významných lokalit (EVL), je Lužnice, protékající mimo jiné Sezimovým Ústím a Planou nad Lužnicí, EVROPSKY VÝZNAMNOU LOKALITOU. Její bližší údaje, včetně zákresu do mapy jsou uvedeny níže.
EVL společně s ptačími oblastmi (na správním území MěÚ Sezimovo Ústí se ptačí oblast nenachází) tvoří evropskou soustavu chráněných území – tzv. NATURA 2000.
Kód lokality: CZ0313106 Biogeografická oblast: kontinentální Celková rozloha lokality: 859,5027 ha Navrhovaná kategorie zvláště chráněného území: CHKO/PR/PP
(symbol * označuje prioritní druhy)
Katastrální území:
Bechyně, Bežerovice, Čelkovice, Čeraz, Černýšovice, Dobronice u Bechyně, Dobřejice, Doubí nad Lužnicí, Drahov, Dráchov, Dražice u Tábora, Dražičky, Hamr nad Nežárkou, Hatín, Hnojná Lhotka, Hodonice u Bechyně, Horky u Tábora, Hosty, Hvožďany u Bechyně, Kardašova Řečice, Klenovice u Soběslavi, Klokoty, Koloděje nad Lužnicí, Křída u Stádlce, Malšice, Nítovice, Novosedly nad Nežárkou, Nuzice, Planá nad Lužnicí, Roudná nad Lužnicí, Rybova Lhota, Řepeč, Řípec, Senožaty u Bechyně, Sezimovo Ústí, Skalice nad Lužnicí, Slavňovice, Soběslav, Stádlec, Stráž nad Nežárkou, Tábor, Třebiště, Týn nad Vltavou, Ústrašice, Val u Veselí nad Lužnicí, Veselí nad Lužnicí, Vlkov nad Lužnicí, Žíšov u Veselí nad Lužnicí